當下,全球微生物組領域蓬勃發展,在地球生態系統和人類健康中,微生物組的作用超乎想象。高通量測序技術的廣泛應用,使我們能夠從全基因組角度研究自然和人體微生物,也使這一領域成為研究熱點。海量數據的產生,使得微生物組學成為一門真正的大數據科學,而數據分析、挖掘也成為微生物組學研究面臨的挑戰和機遇。
隨著二代測序技術的日趨成熟,微生物組研究涉及的樣本量和測序數據量更是快速增加,微生物組大數據的收集、存儲、功能挖掘和開發利用,是制約微生物組發展的核心問題。如何加強微生物資源開發應用與分析挖掘能力?如何提升微生物資源有效利用和科技創新支撐能力?如何更有效滿足生信開發及可視化分析需求,成為當下微生物組研究應用技術轉化亟待解決的難題。
助力某國家級研究所
搭建科技共享服務平臺
榮聯科技集團旗下全資子公司榮聯云生數據科技有限公司(簡稱“云生數據”),專注于生物科技與信息技術深度融合和創新應用,在生物基因數據的采、存、管、用等方面形成了領先的技術優勢,為醫療機構、科研高校、衛生管理部門、藥企、生物科技公司等生態伙伴提供大數據平臺化賦能增值服務。
微生物數據分析平臺作為云生數據自主研發的一款平臺類產品,致力于解決腸道微生物組學數據的存儲、計算、挖掘、共享和轉化問題,形成一站式數據管理、生信分析、操作可視化云平臺,為微生物的篩查、監測、診斷、科研等相關重大問題提供全面分析解決方案。
目前,云生數據已與某國家級研究所合作,共建國家科技資源共享服務平臺,以推進微生物領域科技資源向國家平臺匯聚與整合,加強微生物資源開發應用與分析挖掘,提升微生物資源有效利用和科技創新支撐能力,為科學研究、技術進步和社會發展提供高質量的科技資源共享服務。
(混合云設計方案)
三大模式探索
為精準醫療提供數字支撐
除微生物數據分析平臺之外,云生數據還將打造細分領域專業產品,包括食源性致病菌監測平臺/一體機、病原微生物檢測分析平臺/一體機等,以科技助力微生物檢測,通過微生物數據挖掘、食源性致病菌監測、病原微生物檢測三大模式探索,為精準診斷和治療提供數字支撐。
(三大模式探索)
·MR微生物數據挖掘:
對高通量測序、三代測序等新興分子檢測技術所得的微生物組學數據進行全面系統分析,供未經生物信息學系統培訓的科研人員采用主流分析方法,輕松挖掘微生物組學數據,包括數據處理、統計分析、功能分析和與公共數據集或已知微生物特征進行比較。系統全面分析微生物組學數據,參考目前主流分析方法和工具,輕松挖掘微生物組學數據,實現科研數據的轉化應用和支撐。
·MS食源性致病菌監測:
基于高通量測序數據,通過微生物檢測分析流程和權威數據庫,獲取微生物檢測后結果信息,應用于進出口商品、食品(水)微生物及其致病因子的病原微生物等,通過食源性致病菌監測產品,助力疾病疫情、食品安全的預防與監控。
·MD病原微生物檢測:
對DNA/RNA高通量測序樣本數據進行分析,獲得常見細菌、真菌、病毒等病原微生物的種屬信息,以解決病原診斷的檢出率、時效性和準確性等一系列難點,讓眾多重癥感染患者及時得到精準診斷和治療。
目前,云生數據自主研發的多組學大數據平臺、精準醫療輔助診斷平臺和生信分析一體機等產品已成功服務于科研院所、基因測序企業、醫療機構等近百家國內外客戶。未來,榮聯將依托多年的行業實踐經驗,發揮云生數據在生物醫療行業的專業優勢,有效支撐我國微生物組研究,為國家微生物組計劃的實施提供重要支撐。