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本文介紹了R中最快的高-寬旋轉的處理方法,對大家解決問題具有一定的參考價值,需要的朋友們下面隨著小編來一起學習吧!

問題描述

我正在處理一個表單的簡單表格

date         variable   value
1970-01-01   V1         0.434
1970-01-01   V2         12.12
1970-01-01   V3         921.1
1970-01-02   V1         -1.10
1970-01-03   V3         0.000
1970-01-03   V5         312e6
...          ...        ...

對(日期、變量)是唯一的。我想把這張桌子改成寬幅的。

date         V1         V2         V3         V4         V5        
1970-01-01   0.434      12.12      921.1      NA         NA
1970-01-02   -1.10      NA         NA         NA         NA
1970-01-03   0.000      NA         NA         NA         312e6

我希望以盡可能快的方式完成此操作,因為我必須在包含1e6條記錄的表上重復該操作。在R原生模式中,我認為tapply()reshape()d*ply()都由data.table控制速度。我想用基于SQLite的解決方案(或其他數據庫)來測試后者的性能。以前有人這么做過嗎?是否有性能提升?另外,當”寬”字段的數量(日期)可變且事先未知時,如何在SQLite中將高到寬轉換為寬?

推薦答案

我使用的方法基于tapply所做的工作,但速度大約快一個數量級(主要是因為沒有每個單元的函數調用)。

從Prasad的帖子使用tall計時:

pivot = function(col, row, value) {
  col = as.factor(col)
  row = as.factor(row)
  mat = array(dim = c(nlevels(row), nlevels(col)), dimnames = list(levels(row), levels(col)))
  mat[(as.integer(col) - 1L) * nlevels(row) + as.integer(row)] = value
  mat
}

> system.time( replicate(100, wide <- with(tall, tapply( value, list(dt,tkr), identity))))
   user  system elapsed 
  11.31    0.03   11.36 

> system.time( replicate(100, wide <- with(tall, pivot(tkr, dt, value))))
   user  system elapsed 
    0.9     0.0     0.9 

關于訂單可能出現的問題,應該不會有任何問題:

> a <- with(tall, pivot(tkr, dt, value))
> b <- with(tall[sample(nrow(tall)), ], pivot(tkr, dt, value))
> all.equal(a, b)
[1] TRUE

這篇關于R中最快的高-寬旋轉的文章就介紹到這了,希望我們推薦的答案對大家有所幫助,

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標簽:data.table errorFastestTall-WidepivotinginR exception IT資訊 plyr r reshape s
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