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??? ?轉(zhuǎn)錄組基因數(shù)據(jù)分析是一個(gè)非常前衛(wèi)的IT技術(shù)分支,但通過(guò)這次的課程,同學(xué)們對(duì)轉(zhuǎn)錄組基因數(shù)據(jù)分析將不再陌生。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析一般分為所有基因挖掘、差異基因挖掘、表達(dá)量挖掘、高級(jí)工具挖掘四個(gè)步驟,在本次的課程中我們不僅要對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和挖掘,還對(duì)轉(zhuǎn)錄組技術(shù)理論進(jìn)行了非常深入的研究和探討,更進(jìn)一步的進(jìn)行了數(shù)據(jù)的可視化分析報(bào)告,這對(duì)于更好的理解以及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析有更實(shí)際的應(yīng)用。

===============課程目錄===============

(1)\01、轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ)
├─01、轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ)(上).mp4
├─02、轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ)(下).mp4
├─11-轉(zhuǎn)錄組概述(1).pdf
├─11-轉(zhuǎn)錄組概述.pdf
(2)\02、Windows下轉(zhuǎn)錄組分析軟件的安裝
├─01、Windows下轉(zhuǎn)錄組分析軟件安裝.mp4
├─02、Windows軟件安裝-510.mp4
├─轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析軟件安裝-Windows.zip
(3)\03、Linux下的軟件安裝和一鍵配置轉(zhuǎn)錄組運(yùn)行環(huán)境
├─01、Linux下軟件安裝和一鍵配置轉(zhuǎn)錄組運(yùn)行環(huán)境.mp4
├─02、Linux下軟件安裝-510.mp4
├─13-1-轉(zhuǎn)錄組軟件安裝-Linux(1).pdf
├─13-1-轉(zhuǎn)錄組軟件安裝-Linux.pdf
(4)\04、轉(zhuǎn)錄組Salmon分析流程講解
├─01、Salmon基礎(chǔ).mp4
├─02、Salmon實(shí)戰(zhàn)操作.mp4
├─03、Salmon理論-510.mp4
├─04、Salmon實(shí)戰(zhàn)-510.mp4
├─12-轉(zhuǎn)錄組分析流程Salmon(1).pdf
├─12-轉(zhuǎn)錄組分析流程Salmon.pdf
├─13_salmon_deseq2_go.zip
├─transcriptome_server.zip
(5)\05、DESeq2差異基因分析理論和操作
├─01、DESeq2差異基因分析理論和操作1.mp4
├─02、DESeq2理論-510.mp4
├─03、DESeq2差異基因分析理論和操作2.mp4
├─04、DESeq2實(shí)戰(zhàn)-510.mp4
├─14-差異基因分析理論和實(shí)戰(zhàn)(1).pdf
├─14-差異基因分析理論和實(shí)戰(zhàn).pdf
(6)\06、GO、KEGG富集分析理論和可視化講解
├─01、GO KEGG富集分析理論和可視化講解.mp4
├─02、GO KEGG msigdb富集分析和可視化實(shí)戰(zhàn).mp4
├─03、GO富集理論-510.mp4
├─04、GO富集操作+Cytoscape_clueGO-510.mp4
├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作(1).pdf
├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作.pdf
├─goeast.txt
(7)\07、利用Cytoscape-clueGO進(jìn)行富集分析
├─01、Cytoscape富集可視化Pathway通路映射.mp4
├─02、Cytoscape clueGO進(jìn)行富集分析和網(wǎng)絡(luò)可視化.mp4
├─03、Cytoscape理論和pathway-510.mp4
├─25-Cytoscape繪制網(wǎng)路通路圖(1).pdf
├─25-Cytoscape繪制網(wǎng)路通路圖.pdf
├─cytoscape演示數(shù)據(jù).zip
├─KEGG.zip
(8)\08、GSEA富集分析理論和可視化案例講解
├─01、GSEA富集分析理論和可視化案例講解(GO、KEGG、MsigDB).mp4
├─02、GSEA兩組樣品和時(shí)間序列富集分析.mp4
├─03、GSEA理論-510.mp4
├─04、GSEA實(shí)戰(zhàn)-510.mp4
├─15_GSEA.zip
(9)\09、二代和三代高通量測(cè)序原理
├─01、二代和三代高通量測(cè)序原理.mp4
├─02、中心法則測(cè)序應(yīng)用-510.mp4
├─03、測(cè)序原理-510.mp4
├─21-二代測(cè)序平臺(tái)和原理(1).pdf
├─21-二代測(cè)序平臺(tái)和原理.pdf
(10)\10、轉(zhuǎn)錄組STAR比對(duì)分析流程講解
├─01、轉(zhuǎn)錄組STAR比對(duì)分析流程講解.mp4
├─02、STAR有參操作解釋-510.mp4
├─03、STAR有參操作總結(jié)-510.mp4
├─22-轉(zhuǎn)錄分析流程STAR(1).pdf
├─22-轉(zhuǎn)錄分析流程STAR.pdf
(11)\11、轉(zhuǎn)錄組STAR比對(duì)分析實(shí)戰(zhàn)與IGV可視化、比對(duì)評(píng)估、飽和性檢測(cè)
├─01、轉(zhuǎn)錄組STAR比對(duì)分析實(shí)戰(zhàn)和IGV可視化 比對(duì)評(píng)估 飽和性檢測(cè).mp4
├─02、IGV可視化-510.mp4
├─23-轉(zhuǎn)錄組分析流程-IGV(1).pdf
├─23-轉(zhuǎn)錄組分析流程-IGV.pdf
(12)\12、STAR定量結(jié)果差異基因分析和與Salmon結(jié)果比較
├─01、STAR定量結(jié)果差異基因分析和與salmon結(jié)果比較.mp4
├─23_star_deseq2_go.zip
(13)\13、WGCNA理論分析和注意事項(xiàng)、案例解讀
├─01、WGCNA理論-510.mp4
├─02、WGCNA理論分析和注意事項(xiàng)、案例解讀.mp4
├─24-WGCNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(1).pdf
├─24-WGCNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析.pdf
(14)\14、WGCNA共表達(dá)實(shí)戰(zhàn)
├─01、WGCNA實(shí)戰(zhàn)和網(wǎng)絡(luò)可視化-510.mp4
├─02、WGCNA共表達(dá)實(shí)戰(zhàn).mp4
├─24_WGCNA.zip
(15)\15、轉(zhuǎn)錄組組裝和可變剪接分析理論和實(shí)戰(zhàn)
├─01、轉(zhuǎn)錄組組裝和可變剪接分析理論和實(shí)戰(zhàn).mp4
├─31-轉(zhuǎn)錄本拼裝和可變剪接.pdf
(16)\16、無(wú)參轉(zhuǎn)錄組分析理論
├─01、無(wú)參轉(zhuǎn)錄組分析理論.mp4
├─32-無(wú)參轉(zhuǎn)錄組組裝和注釋.pdf
(17)\17、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組概念
├─01、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組概念.mp4
├─31-單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組基本概念.pdf
(18)\18、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)
├─01、10X拆庫(kù)瀏覽.mp4
├─02、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)獲取-510.mp4
├─03、seurat-monocle-scater包解釋和運(yùn)行.mp4
├─32-單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn).pdf
├─33-單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)獲取.pdf
(19)\19、PCA、TSNE、單細(xì)胞理論和操作
├─01、PCA TSNE理論.mp4
├─02、PCA TSNE單細(xì)胞操作.mp4
├─34-PCA和單細(xì)胞可視化.pdf
├─PCA_scRNA.zip
(20)\20、常用轉(zhuǎn)錄組資源數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介
├─01、常用轉(zhuǎn)錄組資源數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介.mp4
├─33-轉(zhuǎn)錄組案例分析和基因表達(dá)資源數(shù)據(jù)庫(kù).pdf
(21)\21、常見(jiàn)圖形解讀
├─01、常見(jiàn)圖形解讀.mp4
├─02、常見(jiàn)圖形解釋-510.mp4
├─26-轉(zhuǎn)錄組常用圖形解讀(1).pdf
├─26-轉(zhuǎn)錄組常用圖形解讀.pdf
(22)\22、AdobeIllustrator修圖和拼圖
├─01、AdobeIllustrator修圖和拼圖.mp4
├─36_AI.zip
├─36論文圖表.pdf
(23)\23、Linux基礎(chǔ)(一)晚間額外課
├─01、Linux基礎(chǔ) (一)晚間額外課.mp4
├─Linux基礎(chǔ).zip
├─linux簡(jiǎn)介與實(shí)操.pdf
(24)\24、Linux基礎(chǔ)(二)晚間額外課
├─01、Linux基礎(chǔ)(二)晚間額外課.mp4
(25)\25、Excel便捷操作
├─01、excel操作-510.mp4
├─Excel.190511.pptx
(26)\26、發(fā)表文章相關(guān)知識(shí)
├─01、發(fā)表文章-510.mp4
├─35_發(fā)表前準(zhǔn)備.pdf
(27)\27、兩周后的答疑
├─01、兩周后的答疑.mp4

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