微波是一種高頻率的電磁波，其本身并不產生熱。在宇宙、自然界中到處都有微波存在，但由于自然界中的微波不集中，故不能加熱食品。
微波爐是利用其內部的磁控管，將電能轉變成微波，以2450 MHz的振蕩頻率穿透食物來進行加熱的。當微波被食物吸收時，食物內的極性分子(如水、脂肪、蛋白質、糖等)會以每秒24.5億次的頻率快速振蕩，使得分子間互相作用而產生大量熱。
因為微波爐的加熱方式與明火加熱方式不同，雞蛋在微波爐中加熱時，由于外殼和內膜的阻礙，會導致內部水蒸氣無法釋放到外界。水蒸氣越積越多的情況下，雞蛋內部會因壓力過大，發生爆炸。所以微波爐不能用來加熱一些帶有膜殼或外皮的食物，比如雞蛋、板栗等，而如果想要加熱帶外皮或膜殼的食物，需要打破或剝掉外殼，才能放入微波爐中。
除了雞蛋，微波爐也不能用來加熱水。因為微波爐加熱水的原理是基于水分子的振動，在加熱過程中，水在容器內不會大量地流動。當微波爐中的水到達沸點后，也不會發生沸騰，這樣的水被叫作超熱水。咖啡等粉末狀的物質會誘導超熱水在短時間內沸騰，熱水會立即涌出，輕則燙傷，重則發生爆炸 。
除了這些，使用微波爐的注意事項還有很多。比如布類、報紙、再生紙類物品等易燃物品也不可以放入微波爐中加熱；使用微波爐時，不能讓其空轉，這是因為沒有食物或水分在爐內吸收能量時，微波能量會不停地在爐內反射。
本文由石家莊藁城區興安鎮中學高級教師崔會欣進行科學性把關。
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