近日,華大智造對超高通量基因測序儀DNBSEQ-T7的性能進行了全面升級。升級后,搭配全新高通量測序試劑盒V3.0,DNBSEQ-T7可實現更快的測序速度、更高的測序通量以及更佳的數據表現,全面賦能基因組學研究。
基于獨有的DNBSEQ™測序技術,華大智造對DNBSEQ-T7的生化、流體及光學系統進行了全面優化,升級后的DNBSEQ-T7最快可在24小時內生成至少7Tb的數據;同時,對測序載片采用了三角形矩陣式信號位點,在測序產量方面,將DNBSEQ-T7的有效reads數提升至少16%(≥5800M),在相同單位面積的測序載片上實現了更高密度的數據產出。搭配4聯載片平臺、高通量測序試劑盒V3.0并適配華大智造一站式工具包,DNBSEQ-T7每年可測序超過14,000個人類全基因組。
早期客戶試用結果——
客戶坐標:北京
應用方向:WGS,WES,RNA,科研腫瘤等
“相對于升級前的V2.0試劑,使用DNBSEQ-T7高通量測序試劑套裝V3.0搭配FPGA服務器,單張芯片測序平均提升 2.8小時,兩張芯片同時測序平均提升1.8小時。自建庫樣本不同產品均達到測序深度要求,測序數據分析質控均無異常反饋。”
客戶坐標:上海
應用方向:WGS,WES,RNA,單細胞等
“使用華大智造自主研發的文庫轉化試劑盒(APP-D),測試第三方文庫在PE150 測序模式下40個run的性能表現,平均測試結果表明升級后的DNBSEQ-T7在 Total Reads(合格標準≥5500M), Q30和SplitRate等重要指標上依舊表現優異,其中Q30甚至可以達到95%(合格標準≥85%)。”
TOTAL READS (M)、Q30 (%) 、SplitRate (%)的run間統計數據
TOTAL READS(M)、Q30(%)、SplitRate(%)的run間對比數據
客戶坐標:武漢
應用方向:WGS,WES,RNA,單細胞等
“升級后的DNBSEQ-T7雙barcode DNA樣本測試結果顯示Q20、Q30和GC含量等指標無異常情況,滿足質控要求。DNBSEQ-T7高通量測序試劑套裝V3.0和V2.0試劑各文庫產出比一致,保持在較高的水平,數據比對滿足質控標準。”
V3.0測序試劑質控指標(Q20、Q30和GC含量等)
客戶坐標:石家莊
應用方向:WES,WGS
“與官方給出下機數據量及測序時長比較,使用 DNBSEQ-T7 高通量測序試劑套裝 V3.0,PE150單邊測序時長為22小時,符合標準22-24小時。”
結語
目前基于DNBSEQ-T7平臺的已發表文獻超過270篇,已成功助力各應用領域開展多項科學研究,全面推動大人群基因組學、農業基因組學等領域研究發展與成果轉化。
此次升級,打造了通量更高、速度更快、數據質量更佳的DNBSEQ-T7測序平臺,可廣泛適用于全基因組測序、超高深度全外顯子組測序、表觀基因組測序、轉錄組測序和腫瘤大Panel基因檢測等大型基因測序項目。同時,DNBSEQ-T7高通量測序試劑套裝V3.0在大幅提升數據產量的基礎上進一步為用戶節約成本。